Lorsque les Croisés ont occupé Jérusalem, ils ont commis un massacre odieux, où ils ont tué un grand nombre d'enfants, de femmes et d'hommes, ils ont été enterrés dans le cimetière et lorsque le sultan Saladin a libéré Jérusalem des Croisés, il a ordonné l'enterrement de ceux qui ont été martyrisés dans les batailles avec les Croisés dans le cimetière lui-même, qui comprend les restes d'un grand nombre de scientifiques, juristes, écrivains, notables et dirigeants, l'enterrement s'y est poursuivi jusqu'en 1927

Après la Nakba, les autorités d'occupation israéliennes l'ont soumis à la disposition du soi-disant gardien des biens des absents, où il l'a progressivement détruit, et il ne restait que 5% de ses tombes . Après la guerre de 1967, les autorités d'occupation israéliennes en ont rasé une grande partie au bulldozer et l'ont transformée en parc public .en 1985, un parking a été construit sur une autre partie. en 1997, certaines tombes ont été exhumées sous prétexte de prolonger les canalisations d'égouts pour traverser le cimetière. en 2008, la Cour suprême de l'occupation a approuvé la construction du soi-disant Musée de la tolérance" sur une partie de ce qu'il en reste.

En 2010 ,la" Fondation Al-Aqsa pour la reconstruction des lieux saints islamiques " a mis en œuvre un projet de restauration et d'entretien du cimetière, au cours duquel (934) tombes ont été restaurées et les déchets déversés par la municipalité d'occupation dans le cimetière ont été enlevés, puis l'occupation a arrêté les travaux de restauration, et la municipalité d'occupation et le soi-disant Département des Terres d'Israël ont commencé à démolir plus de (300) tombes dans le cimetière.